Originaire de l’Oberland bernois, Anja von Allmen a appris à naviguer en Optimist à l’âge de 9 ans. À 15 ans, elle a remporté la médaille de bronze chez les filles aux Championnats du monde de Chypre et est ensuite passée à la classe ILCA 4 où elle a rapidement remporté le titre mondial et européen chez les filles. Lors de sa dernière année en tant que junior, en 2021, elle a remporté deux fois le titre de Vice-Championne du monde en ILCA 6 lors des Championnats du monde U19 à Arco (ITA) et des Championnats du monde ISAF U19 à Oman. En 2024, Anja von Allmen a eu la chance de participer à la première Coupe de l’America féminine à Barcelone en tant que régleuse avec l’équipe Alinghi Red Bull Racing.
Elle s’entraîne désormais au sein de l’équipe nationale, avec l’objectif de se battre pour les médailles aux Jeux olympiques de 2028.